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蛋白质数据库是什么网站
1、蛋白质数据库是指包括蛋白质信息的数据库。常用的蛋白质数据库有很多,其中Uniprot被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。Uniprot下包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD,详见Uniprot_百度百科。
2、它提供了各种数据库和工具,包括基因序列数据库、蛋白质数据库、文献数据库、生物信息学工具等,为科研人员提供了丰富的资源和便捷的数据分析平台。在NCBI的网站上,我们可以找到各种有关生物技术的信息和资源。
3、蛋白质数据库(HPDB),建于2005年5月, 动态展示生物大分子立体结构,鼠标点击放大分子结构、原子定位、测定原子之间距离,可用于教学或科研。
uniprot蛋白质序列数据库由哪几部分组成?各有什么特点
以常见的牛血清白蛋白(BSA)为例,首先下载BSA的数据库信息 首先sp表示,Swiss-Prot数据库是注释精炼的蛋白序列库,它的所有序列都经过了科学家的查阅文献核实(reviewed, manually annotated) 。
UniProt是 Universal Protein 的英文缩写,是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。它由整合Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD 三大数据库的数据而成。他的数据主要来自于基因组测序项目完成后,后续获得的蛋白质序列。
蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)是一个生物大分子,如蛋白质和核酸,的数据库。
UniProt和PIR家族信息是两个不同的分子序列数据库。UniProt是一个全球性的数据库,收录了从细胞到基因组的所有生物序列的完整信息。
列举两个蛋白质次级数据库
以具有特殊功能的蛋白为基础构建的二次数据库有免疫球蛋白数据库Kabat,蛋白激酶数据库PKinase等。
蛋白质直系同源簇(COGs)数据库是对细菌、藻类和真核生物的21个完整基因组的编码蛋白,根据系统进化关系分类构建而成。COG库对于预测单个蛋白质的功能和整个新基因组中蛋白质的功能都很有用。
国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。
蛋白质组学目前有哪些数据库
蛋白质结构数据库 包含来自X线晶体学和三维结构的实验数据。其数据从PDB(Protein Data Bank)获得。
PIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列* (MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库,可在这里下载。
蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)是一个生物大分子,如蛋白质和核酸,的数据库。
即UniRef100、UniRef90和UniRef50;■ (3) UniParc (UniProt Archive),是UniProt存档库 ,收录所有蛋白质序列。用户可以通过文本查询数据库,可以利用BLAST程序搜索数据库,也可以直接通过FTP下载数据。
除了PIR外,另一个重要的蛋白质序列数据库则是SwissProt。该数据库由瑞士日内瓦大学于1986年创建,目前由瑞士生物信息学研究所(Swiss Institute of Bioinformatics,简称SIB)和欧洲生物信息学研究所 EBI共同维护和管理。
PDB数据库简介
PDB(Program DataBase),全称为“程序数据库”文件,是VS编译链接时生成的文件。DPB文件主要存储了VS调试程序时所需要的基本信息,主要包括源文件名、变量名、函数名、FPO(帧指针)、对应的行号等等。
pdb是程序数据库文件。pdb的全称为palm database,为palm os操作系统中的数据文件类型。通常我们在使用palm系统的电子书时都会使用到此文件。
PDB是目前最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库,是通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段确定的蛋白质、多糖、核酸、病毒等生物大分子的三维结构数据库。
PDB是由世界蛋白质数据库(Worldwide Protein Data Bank,wwPDB)管理。
程序数据库 (PDB) 文件保存着调试和项目状态信息,使用这些信息可以对程序的调试配置进行增量链接。
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