蛋白质数据库有哪些类型（常用的蛋白质数据库有哪些）

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蛋白质三级结构数据库是《生物信息学》里面的内容。

蛋白质沉淀：指蛋白质从溶液中析出的现象。1 盐析：向蛋白质溶液中加入高浓度的中性盐，破坏蛋白质在水溶液中的稳定性因素，从而析出蛋白质的方法，叫盐析。

蛋白质是一切生命的物质基础，是肌体细胞的重要组成部分，是人体组织更新和修补的主要原料，没有蛋白质就没有生命。蛋白质是由20多种氨基酸组成，以氨基酸组成的数量和排列顺序不同，使人体中蛋白质多达10万种以上。

种类齐全，数量充足，比例适当，叫完全蛋白质，如动物蛋白质和豆类蛋白质。种类齐全，便比例不适当，叫半完全蛋白质，在谷物中含量较多。种类不全，叫不完全蛋白质，如肉皮中的胶质蛋白，平米中的平米胶蛋白。

当时他们注意到的例子有来自蛋清、血液、血清白蛋白、纤维素和小麦面筋里的蛋白质。荷兰化学家Gerhardus Johannes Mulder对一般的蛋白质进行元素分析发现几乎所有的蛋白质都有相同的实验公式。

蛋白质名称的来历：蛋白质(protein)一词由19世纪中期荷兰化学家穆尔德(Gerardus Mulder)命名。当时，穆尔德从动物组织中和植物体液中提取出一种共同的物质，他认为这种物质存在于有机界的一切物质中。

蛋白质数据库有哪些类型（常用的蛋白质数据库有哪些）

1、做基因功能的人都会特别注意基因上有什么功能结构域，通常我们认为，结构域决定了这个基因的功能。

2、看看pfam， prints等二级结构数据库进行分析根据资料显示ccd预测蛋白质结构域要看pfam， prints等二级结构数据库进行分析蛋白质是组成人体一切细胞、组织的重要成分。机体所有重要的组成部分都需要有蛋白质的参与。

3、InterProScan：蛋白质结构域和功能位点的集成数据库，它将SWISS-PROT、TrEMBL、PROTSITE、PRINTS、PFAM、ProDom等数据库提供的蛋白质序列中的各种局域模式，如结构域、基序等信息统一起来，提供了较为全面的分析数据。

以常见的牛血清白蛋白（BSA）为例，首先下载BSA的数据库信息首先sp表示，Swiss-Prot数据库是注释精炼的蛋白序列库，它的所有序列都经过了科学家的查阅文献核实(reviewed， manually annotated) 。

UniProt是 Universal Protein 的英文缩写，是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。它由整合Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD 三大数据库的数据而成。他的数据主要来自于基因组测序项目完成后，后续获得的蛋白质序列。

蛋白质数据库（Protein Data Bank， PDB）是一个生物大分子，如蛋白质和核酸，的数据库。

UniProt和PIR家族信息是两个不同的分子序列数据库。UniProt是一个全球性的数据库，收录了从细胞到基因组的所有生物序列的完整信息。

SWISS--PROT是由Geneva大学和欧洲生物信息学研究所(EBI)于1986年联合建立的，它是目前国际上权威的蛋白质序列敬据库。SWISS--PROT中的蛋白质序列是经过注释的。

UniProt数据库蛋白组学常用数据库UniProt（全称UniProt Protein Resource），建立于1986年，由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白质数据库联合成立的，其信息量丰富、资源广泛，是目前公认的首选免费蛋白质数据库。

除了PIR外，另一个重要的蛋白质序列数据库则是SwissProt。该数据库由瑞士日内瓦大学于1986年创建，目前由瑞士生物信息学研究所(Swiss Institute of Bioinformatics，简称SIB)和欧洲生物信息学研究所 EBI共同维护和管理。

swiss-prot：最齐全的注释精炼的蛋白序列数据库，建立于1986年，1987年起由日内瓦大学(University of Geneva)医学生物化学系和 EMBL 数据馆(即现在的欧洲生物信息研究所EBI)共同维护。

SWISS-PROT是经过注释的蛋白质序列数据库，由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护。

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