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怎么使用ncbi的entrez检索工具
1、有用。WORD=Text Word， TITL=Title Word ncbi中Entrez检索功能如下：(1)Entrez支持*号截词检索；(2)Entrez对你键入的词可以进行逻辑识别。
2、所有的NCBI资料库和软体工具可以从或FTP来获得。NCBI还有E-mail伺服器，提供用文本搜寻或序列相似搜寻访问资料库一种可选方法。 NCBI首先创建GenBank资料库，在重点开发GenBank的同时，又于1991年开发了Entrez 资料库检索系统。
3、直接用关键词 Homo sapiens mitochondrion 在genome数据库中搜索就行了。找complete genome 这是找到的。
如何使用PDB查询蛋白质结构
PDB网站的查询方式其实很简可是输入ID，也可以直接输入你要查找的蛋白的英文名字，数据库提供的都是已经解析的蛋白，因此，里面会有详细的介绍该蛋白的各个特征，包含结构，活性中心以及底物等。
。在NCBI或者BLAST中找到这段序列所在蛋白质的名称，以及其它所有用过的名字或者别名 2。在PDB中搜索这些名字或名称，看有没有存在的结晶结构， 大多数是NMR的或者X-ray的。3。
用你要查的神经氨酸酶的英文名称 或者简称 或者你知道的PDB编号 在PDB里搜索，会出现很多相关蛋白。
找科研文献比较容易：你可以上google学术搜索，输入感兴趣的关键词（包括基因名称、蛋白名称、物种名称、作者、作者单位等等等）就行；你可以登录NCBI网站，在里面的pubmed数据库中输入相关关键词进行搜索。
)选择和自己模拟目的相贴切的结构，通过对比该结构的分类、来源、解析方法等选择合适的蛋白结构。亦可通过阅读解析蛋白的文章，进一步确认该结构是否为自己所需。
在NCBI或者直接在PDB上查Serum albumin，点开牛来源的。在PDB的右侧有一个下载，点击下载pdb文件就行了。这个用RASMOL之类的软件都能打开，打开怎么编辑我也不清楚。。
如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列
1、包括研究1个人群、1个种系产生或描写人群变化的1组组联合序列。PopSet既包括核酸序列数据又包括蛋白质序列数据。Entrez 功能强大，在于它的大多数记录可相互链接，既可在同1数据库内链接，也可在数据库之间进行链接。
2、首先打开电脑主界面，在主界面点击浏览器进入。其次搜索UniProt数据库，点击进入。最后再序列条目总数查询即可。
3、以常见的牛血清白蛋白（BSA）为例，首先下载BSA的数据库信息 首先sp表示，Swiss-Prot数据库是注释精炼的蛋白序列库，它的所有序列都经过了科学家的查阅文献核实(reviewed， manually annotated) 。
4、中括号中为该蛋白的种属信息，选择合适的蛋白质查看详情。选定结构后，下载该蛋白的序列信息；2)也可将搜索选项设置为“Structure”，搜索相关结构信息；3)序列比对得到相关蛋白序列后，也可通过“tblastn”模块，比对相似序列。
5、使用生物信息学数据库：访问生物信息学数据库，如NCBI（美国国家生物技术信息中心）的Gene数据库或UniProt（万维网联合蛋白资源库）等。这些数据库提供了大量的基因和蛋白质信息。
怎样把pfam,hmmsearch,smart等工具结合使用
自动升级方法：选中一个下级框，SMARTART工具-设计-创建图形-升级，即可实现。手工方法：可以手工将上级图框复制、移动，实现多个上级对应一个下级。
完全基于Excel的报表开发工具。在Excel中安装Smartbi电子表格插件，直接让Excel作为一个报表开发工具。使用Smartbi数据接口实现动态数据获取。
Pfam有两个组成部分：Pfam - A和Pfam - B。 Pfam -A的质量比较高，是人工筛选的。虽然这些Pfam -A的数据涵盖了在许多基础序列数据库中很大的比例，为了让更多的全面了解已知蛋白质，我们也支持使用ADDA数据库。
