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生物信息学数据库常用的三种序列格式
bed（Browser Extensible Data）：是ucsc 的genome browser的一个格式，描述注释的数据。
步骤：进入google首页，搜索genefisher，进入主页，复制fasta格式，chechk input， sunmit， ； ；设置一下引物长度为20-25bp，扩增产物长度300-500bp，退火温度为50-60℃； 。
fasta格式形式如下图，由两部分组成。第一部分 ：以大于号“ ” 开头，接着是序列的标 识符“gi|187608668|ref|NM_001043362|”，然后是序列的描述信息。
在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式）是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。
稍次一点的杂志，如BMC，也是生物信息学的专刊。2012年度IF=447 对于计算向的生物信息学，PLOSBiology是一个很好的期刊。2012年度IF=215 除此之外，NatureMethod，也会有生物信息学相关的方法发表。
生物信息学中的常用的核酸二级数据库有哪些
ENA（EMBL）、GenBank。EuropeanNucleotideArchive（ENA），是欧洲分子生物学实验室（EMBL）所运营的一个公共数据库，致力于收集、存储、管理和分发不同类型的核苷酸序列数据及其中的注释信息。
国际上著名的一级核酸数据库有Genbank数据库、EMBL核酸库和DDBJ库等；蛋白质序列数据库有SWISS-PROT、PIR等；蛋白质结构库有PDB等。
像genebank，EMBL这种都是不加选择的一级数据库，只要是实验获得的，不管什么东西的序列，哪怕是不完整的序列都能上传，而且它们的数据也有可能有重复。
生物信息学数据库之间的联系方式有
1、收集，维护，生物信息学数据库可以分为4大类：即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构数据库、生物大分子三维空间结构数据库。
2、使用生物信息学数据库：访问生物信息学数据库，如NCBI（美国国家生物技术信息中心）的Gene数据库或UniProt（万维网联合蛋白资源库）等。这些数据库提供了大量的基因和蛋白质信息。
3、要寻找一个基因的全长同源序列在其他物种中，你可以使用生物信息学工具和数据库进行比对和搜索。
4、二次数据库是以一次数据库为基础设立的，补充了一次数据库的欠缺，这是二者之间的联系。
5、层次型，网状型和关系型数据库划分原则是数据之间的联系方式。层次数据库也是按记录来存取数据的。层次数据模型中最基本的数据关系是基本层次关系，它代表两个记录型之间一对多的关系，也叫做双亲子女关系。
6、层次型网状型和关系型数据库划分原则是数据之间的联系方式。层次数据库也是按记录来存取数据的。层次数据模型中最基本的数据关系是基本层次关系，它代表两个记录型之间一对多的关系，也叫做双亲子女关系。
