蛋白质数据库有哪些类型的(简述蛋白质序列数据库的主要种类和特点)

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本文目录一览:

列举两个蛋白质次级数据库

1、国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。

2、PIR和PSDPIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列* (MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库。

3、一级核酸数据库、二级核酸数据库、蛋白质数据库一级蛋白质数据库三大类。具体如下:一级核酸数据库:存储的是通过各种科学手段得到的最直接的基础数据。如测序获得的核酸序列等。

4、PDB蛋白质晶体结构资料数据库(ProteinDateBank)。PDB数据库的维护由结构生物信息学研究合作组织(ResearchCollaborationforStructuralBioinformatics,RCSB)负责。

蛋白质三维结构数据库的功能

1、pdb是protein data bank(蛋白质数据库)的缩写,是全球最大的蛋白质三维结构数据库。在生物学、医学等领域里,研究人员可以利用pdb数据库来确定已知蛋白质的三维结构,并且探索蛋白质与其他生物分子之间的相互作用。

2、蛋白质数据库(HPDB),建于2005年5月, 动态展示生物大分子立体结构,鼠标点击放大分子结构、原子定位、测定原子之间距离,可用于教学或科研。

3、主要是蛋白质的三维结构,还包括核酸、糖类、蛋白质与核酸复合物的三维结构。信息原子的空间坐标、引用文献、形成α-helix和β-sheet的氨基酸序列、双硫键连结模式、与蛋白质结合的ligand、参与生化功能的residue等。

4、蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB)是美国纽约Brookhaven国家实验室于1971年创建的。

5、蛋白质直系同源簇(COGs)数据库是对细菌、藻类和真核生物的21个完整基因组的编码蛋白,根据系统进化关系分类构建而成。COG库对于预测单个蛋白质的功能和整个新基因组中蛋白质的功能都很有用。

蛋白质数据库是什么?

蛋白质数据库(HPDB),建于2005年5月, 动态展示生物大分子立体结构,鼠标点击放大分子结构、原子定位、测定原子之间距离,可用于教学或科研。

蛋白质数据仓库(PDB)是国际上唯一的生物大分子结构数据档案库,由美国Brookhaven国家实验室建立。PDB收集的数据来源于X光晶体衍射和核磁共振(NMR)的数据,经过整理和确认后存档而成。

蛋白质序列数据库指应用计算机功能分析生物学信息的数据库。应用计算机的运算法则,比较DNA和蛋白质序列而检测结构、功能和序列之间的进化关系。

蛋白质数据库:这些数据库存储了各种生物体的蛋白质序列信息,包括氨基酸序列、结构信息和功能注释等。这些数据库的特点是数据量大、复杂度高,需要使用专业的生物信息学工具进行分析和解释。

蛋白质三级结构数据库是《生物信息学》里面的内容。

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